Anscheinend hast du die vorigen Antworten dazu entweder nicht gelesen, oder nicht verstanden. Weiterhelfen kann ich dir an der Stelle auch nicht.
Du hast bislang keinerlei brauchbare Informationen ( z.B. zu dem FTP-Server, dessen Einstellungen, wie es lokal zu der Problemzeit auf dem lokalen Dateisystem des Servers aussieht etc. ) gegeben,
die Hinweise ignoriert dass die Vorgehensweise und das was du dazu erläutert hast, recht unausgegoren klingt. An der Stelle auch nochmal der Hinweis, dass weder Thunar, noch Dolphin oder Files native FTP-Clients sind.
Was erwartest du jetzt genau ? Dass wir ein bißchen an der Kristallkugel rubbeln?